Les activités de recherche sont menées dans le cadre de cinq laboratoires :
- Laboratoire d'Erémologie et Lutte Contre la Désertification,
- Laboratoire d'Aridoculture et Cultures Oasiennes,
- Laboratoire d'Elevage et Faune Sauvage,
- Laboratoire d'Economie et Sociétés Rurales.
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